Spolecnost je clenem Federace evropských mikrobiologických spolecností (FEMS) a Svetového svazu mikrobiologických spolecností (IUMS). Clenství prinásí cetné výhody, mj. moznost financní podpory porádaných semináru a konferencí, cestovní stipendia pro mladé vedce nebo pokrytí predplatného nekterých casopisu. Stipendium FEMSu získali v poslední dobe napr. Vladimír Celer, Katarína Kollárová, Michaela Schierová nebo Dana Baudisová.

Fakt, ze Ceskoslovenská spolecnost mikrobiologická je respektovaným clenem mezinárodních organizací, se nejvíce projevil v r. 1994, kdy bylo Ceskoslovensko povereno organizací Svetového mikrobiologického kongresu. Akce v prazském Paláci kultury (dnes Kongresovém centru) se zúcastnilo více nez 2000 vedcu z 59 zemí. Dík za úspesný prubeh kongresu nálezí organizátorum pod vedením Bohumila Sikyty.