Od svého vzniku Spolecnost udeluje clenum, obzvláste zaslouzilým o ceskoslovenskou mikrobiologii a chod Spolecnosti cestné clenství.
V soucasnosti jsou cestnými cleny CSSM:

Eva Aldová, Vladimír Bartl, Dionýz Blaskovic, Ladislav Borecký, Libor Ebringer, Miroslav Ferencík, Jirí Häusler, Milan Hejtmánek, Sir David Hopwood, Jirí Chaloupka, Jarmila Jelínková, Ctirad John, Karel Krovacek, Miloslav Kocur, Jindrich Leopold, Erich Minárik, Vilém Muzikár, Oldrich Necas, Leopold Pospísil, Zdenek Rehácek, Augustín Sokol, Bohumil Sikyta, Jan Smarda, Ján Stefanovic, Jaroslav Sterzl, Zdenko Vanek, Stanislav Zadrazil

Patockova medaile (vpravo) byla zrízena v roce 2000. Je urcena pro vynikající vedce, zaslouzivsí se o ceskou a slovenskou mikrobiologii. Medaili, jejíz návrh zpracovala akademická socharka M. Cvengrosová, vyrobila mincovna v Kremnici.
Medaili dosud obdrzeli:

v roce 2007
Václav Sasek, Miroslav Votava, Karel Sigler, Vladimír Farkas
v roce 2006
Jan Smarda, Arnold Demain
v roce 2005
Vladimír Bartl, Alena Tomsíková
v roce 2004
Jaroslav Spízek, Ivan Ciznár, Zdenko Vanek, Fridrich Görner, Zdena Jesenská, Ján Stefanovic
v roce 2003
Jirí Häusler, Vilém Muzikár, Jarmila Jelínková
v roce 2002
Eva Aldová
v roce 2001
Ladislav Borecký, Libor Ebringer, Jirí Stárka
v roce 2000
Ctirad John a Jirí Chaloupka.

V r. 1996 byla zrízena Cena pro mladého ceského a slovenského mikrobiologa, jez je urcena pro clena CSSM, který v roce udelení nedovrsil 35. rok veku a dosáhl v oboru významných výsledku, které publikoval v mezinárodních casopisech. (Více informací viz Bulletin CSSM XXXVI (1995) str. 203-204).
Cenu dosud získali:

v roce 2007
Eva Spitálská (Virologický ústav SAV, Bratislava) a Marta Monincová (Prírodovedecká fakulta MU Brno)
v roce 2006
Gabriela Novotná, Marek Basler (Mikrobiologický ústav AVCR, Praha)
v roce 2005
Martin Mokrejs (Prírodovedecká fakulta UK, Praha), Silvia Melkusová (Virologický ústav SAV, Bratislava)
v roce 2004
Jana Melnicáková (Virologický ústav SAV, Bratislava), Miroslav Kolarík (Mikrobiologický ústav AVCR, Praha)
v roce 2003
Renáta Melková (Slovenská zdravotnícka univerzita, Bratislava), David Smajs (Lékarská fakulta UP, Olomouc)
v roce 2002
Zbynek Prokop (Prírodovedecká fakulta MU, Brno), Radim Osicka (Mikrobiologický ústav AVCR, Praha)
v roce 2001
Andrea Papajová (Prírodovedecká fakulta UK, Bratislava, Michal Koblízek (Ústav ekologie krajiny AVCR a Mikrobiologický ústav AVCR, Trebon)
v roce 2000
Pavel Svec (Ceská sbírka mikroorganismu, Brno), Andrea Jesenská (Prírodovedecká fakulta MU, Brno), Jozef Nosek (Prírodovedecká fakulta UK, Bratislava)
v roce 1999
Petr Baldrian (Mikrobiologický ústav AVCR, Praha), Lubomír Tomaska (Prírodovedecká fakulta UK, Bratislava)
v roce 1998
Elena Piecková (Ústav preventívnej a klinickej medicíny, Bratislava), Zuzana Storchová (Prírodovedecká fakulta UK, Praha)
v roce 1997
Martina Macková (Vysoká skola chemicko-technologická, Praha), Jirí Damborský (Prírodovedecká fakulta MU, Brno)
v roce 1996
Jirí Gabriel (Mikrobiologický ústav AV CR, Praha), Ervin Fodor (Virologický ústav SAV, Bratislava)